Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IHHQ14623 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms