Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms