Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TCOF1Q13428 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TCOF1Q13428 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TCOF1Q13428 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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