Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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