Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D2

FAM69C, Protein FAM69C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69CQ0P6D2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM69CQ0P6D2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM69CQ0P6D2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms