Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms