Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAMSAP2Q08AD1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms