Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms