Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms