Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms