Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms