Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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