Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms