Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms