Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF6P18850 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF6P18850 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF6P18850 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF6P18850 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms