Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms