Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms