Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms