Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms