Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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