Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TISP43B9A030 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms