Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms