Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms