Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms