Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms