Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms