Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms