Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TINF2Q9BSI4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms