Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAAF1Q9BRP4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms