Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms