Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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NIPSNAP1Q9BPW8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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NIPSNAP1Q9BPW8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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NIPSNAP1Q9BPW8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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NIPSNAP1Q9BPW8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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