Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAP3Q96P50 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms