Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 434 ms