Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms