Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms