Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP31Q70CQ4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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