Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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