Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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