Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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