Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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