Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL19A1Q14993 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms