Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms