Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms