Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFRD2Q12894 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms