Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1B1Q10567 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms