Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms