Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NESP48681 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NESP48681 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NESP48681 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms