Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms