Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD1P33897 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms