Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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OTX2P32243 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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OTX2P32243 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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OTX2P32243 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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